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青杨学姐研究生学习不单是对专业的理解程度的拔高，更是各种技能的熟练过程。对科研软件的熟练掌握不仅有助于学习，对未来的职业生涯也会起到一定的帮助。
36款软件合集每个部分尽量从入门和进阶两个层次介绍，希望对不同阶段的同学都有帮助。
一、参考文献管理
（1）入门软件：
CNKIE-Study（知网研学）
集文献检索、下载、管理、笔记、写作、投稿于一体的文献管理软件。支持CNKI、wiley、Springer、ScienceDirect等二十多个数据库的文献保存。目前仅支持windows，比较适合刚入门、中文文献阅读和写作的小伙伴。
（2）进阶软件：
EndNote
是广大科研劳动力最常用的文献管理软件，可以在pubmed上检索文献直接导入数据库，对参考文献可以自动编号。和下面两个不同，EndNote不提供免费版本。学生用盗版也还是可以理解的，毕竟很贵。同为网络版设计，其实也可以考虑Mendeley和Zotero。
Mendeley
和EndNote虽然同为进阶阶段的软件，但是操作简单易入门。背靠Elsevier，资源没得说，而且免费安装。这个软件支持pdf在线阅读，文献导入方便，且有2GB的在线存储空间。
Zotero
一款开源的文献管理工具，可以作为浏览器插件使用，Zotero的网络服务器上可以上传本地的Zotero的文献数据库。无限级目录分类，目录下可分许多子目录，还可以为参考文献自定义标签。
二、文献阅读
这部分无论是入门还是进阶，操作起来难度都不大，主要是功能是否全面的区别。
（1）入门软件（单纯的阅读标记）：
PDF阅读器
目前常见的pdf阅读器，比如adobereader，福昕阅读器，甚至是wpsoffice都支持pdf版本的文献阅读和笔记添加。对于阅读功能要求不大的同学完全用这类pdf阅读器就足够了。
CAJViewer
和CNKIE-Study同样是中国知网旗下的软件，虽然支持caj、nh、kdh、teb、pdf等多种文献格式，但主要还是用于阅读和编辑CNKI系列数据库的文献阅读器。
（2）进阶软件（支持云端保存等功能）：
有道云笔记
是进阶版阅读笔记里我最推荐使用的，支持markdown语言，适合国人的操作习惯，无需额外付费情况下可以满足基本功能的使用。包含基础的office套件，可以导出pdf格式文件。
印象笔记
也是比较主流的一个阅读笔记软件，支持markdown语言。给我的感觉就是偏科，比如同步和处理速度都很快，基础操作可以满足。但是office套件支持不全面，语音文字转换不清晰，不支持批量导出。此外如果想分享给他人，需要对方也是印象笔记用户这一点限制颇多。导出格式支持enex/html/mht，适合程序语言学习的同学。
为知笔记（收费）
为知笔记最大的bug就是收费，它只有一段时间的免费试用期。基础功能都能满足，office套件最全是不支持OCR识别，处理和同步的速度较慢。导出格式支持html/mht/txt。
三、数据处理
1数据分析软件
（1）入门软件
MicrosoftOfficeExcel/WPSoffice
这个软件其实不必多说，最常规的数据处理软件，也能做点简单的图表。如果对数据处理的需求不是特别高的话其实有excel完全就可以满足。无论是MicrosoftExcel还是WPS的表格，其实功能上都差不多。
（2）进阶软件
SPSS
SPSS这个软件操作其实不算难，百度学习一下上手也很快。很多人觉得SPSS难是因为之前用的Excel操作是保姆级，我们懒于动脑琢磨。还有一个原因就是SPSS相对Excel的数据处理更加专业化，同样是回归分析其实也分很多种，但是很多同学不知道区别，这是数学知识的掌握不足，并不是SPSS操作难。数据处理毫无疑问要比Excel强大，但是图表实在是欣赏不起来。
2数据作图软件
能做图的软件肯定也能做数据分析，单拿出来说是因为做图需求还是很有专业局限性的，这一部分就不分入门和进阶介绍了，只介绍我接触过的软件。
GraphpadPrism
这个软件常规科普贴提到的不多，写出来是因为我一个生物学专业的总要用这个软件作图。操作也不复杂，只是专业性很强就放在了进阶版介绍。尤其算半数生存率，生存曲线等简直不要太好用。图里点击对应位置可以直接修改格式，特别方便，图片分辨率也高。生物/医学学生必备。
MATLAB
耳熟能详的数据处理作图软件，我在做数学建模的时候曾经用过这个软件作图。但老实说，这个软件需要编程，作图不是主要目的，它的数据处理功能才是最重要的。虽然MATLAB作图总被用户笑称锯齿风，但我个人觉得还好。
Origin
Origin不需要编程，是一款专业函数绘图软件，简单易学，功能强大。对于一般需求的用户完全可以满足，也是主流的工科制图软件，当然也可以应用于别的学科。缺点就是系统不太稳定。
四、文章撰写
1排版软件
（1）入门软件
MicrosoftOfficeWord/WPSoffice
这两款软件之前也提到了很多次，这么一看还真是科研工作者基本标配。二者大体功能上没有太大区别，但是我个人认为Microsoft打出来的公式更好看一些，但是WPS的云保存真的是很应急，面对突发情况还是云保存安心。对于常规的文章撰写这两款哪一个都足够了。而且国内学校的毕业论文我还是建议用这两款软件写，常规的最不容易出错，毕业面临送审，修稿，还是基础款比较靠谱。
（2）进阶软件
TexMaker
一款免费且功能强大的LaTeX编译器，LaTeX排版的优缺点很多同学都知道。优点：排版好看，无论是格式布局看起来的舒适度还是公式编辑的规范化都很OK。缺点：操作需要基础的编程，而且主流还是用于英文的书写排版。
Scrivener
在国内并不算一个主流软件，但是口碑不错。标签式索引很适合收纳狂，目录功能很强大。可以全屏写作，记笔记。虽然没有云保存，但是有自动备份，同样可以减少意外丢失。
除了这些，其实前面提到的一些文献阅读软件比如印象笔记，有道云笔记其实也可以进行文章的撰写，但可能很多人在习惯上很难适应。
2英文润色软件
Stylewriter
支持文章写作的检查和修改，相比于纠错，其实主要是对语言的润色，使语句处理之后更加的流畅易读，但是一些拼写错误也会标注出来。软件会计算bog指数来反应文章的可读性，这个功能十分贴心。
五、图像处理软件
图像处理是对实验结果图的优化和计算过程，科研修图也不是造假，是把实验结果图调整角度，对比度等，让你的实验图在不影响结论的前提下看起来更加的清晰美观。
1修图软件
（1）入门软件
系统自带图片软件
虽然看起来不是很专业，但是之前也说了，科研修图其实也就是调调对比度，饱和度，图像旋转这些简单的操作让图片看起来更好看。如果要求不高，真的可以用系统自带的图片软件进行操作。
（2）进阶软件
AdobePhotoshop
我们常说的PS，就算是专业的修图人士都在用的修图软件，好用自不必说。对于我们这种搞科研的同学，修图其实只占据一小部分学习内容，PS神器一个足够。输出的格式也很多，调整角度，描边，对比度。所有科研修图的要求都可以搞定。
2图形计算软件
ImageJ
主要应用于医学，生物学，影像学等专业。支持多种图片格式的导出，除了基本的图像操作，还可以对图片的区域和像素进行统计、对图形的间距、角度进行计算、生物医学中的灰度分析、粒径统计等计算操作都可以用这个软件完成。
除了ImageJ，很多生物成像仪也有自带的图像处理和计算软件，其实大可不必再另外下载。我就是用BIO-RAD的成像软件，本身就可以处理图像和计算。
六、模式图绘制软件
1入门软件
MicrosoftOfficePowerPoint//WPSoffice
老伙伴又来了，微软的Office和WPS真的是垄断科研软件好大一片天。我们常用的模式图，很多人最开始都是用这类软件进行绘制的。优点自不必说，简单易上手。但是图的美观程度很难保证。我第一篇综述里的模式图就是用PPT做的。
2进阶软件
AdobeIllustrator
一款非常专业的矢量图制作软件。如果你有耐心，追求完美的模式图绘制，AI绝对是最好的选择。有些同学可能觉得像AI，PS这种绘图软件里的图层很麻烦，但熟练操作之后你就会发现图层存在的意义真的是十分必要。软件没有模板原件可以导入，全靠自己绘制或者基础形状调整，但是出来的图会更加灵动。我的第二篇综述里的模式图就是用AI绘制的，强烈推荐。
PathwayBuilderTool
一款在医学研究常用的信号通路作图软件。操作十分简单，放在进阶部分讲是因为这个软件专业性强。医学生物学专业的学生很多选用这个软件作图。里面有很多的模板和原件可以直接添加。缺点就是，这些模板和原件虽然一看就很专业，但真的太丑了。如果追求专业性美观性的话可以考虑这款软件。
七、思维导图绘制
OfficePowerPoint和WPS就不再说了，都能自力更生做模式图了，基础的流程图示意图还是不在话下的。不过做成什么样就还挺取决于技术和审美的。简单说几个这类的主流制图软件。这部分我觉得操作难度都差不多，就并列来写了。
Visio
我们常用的Office三件套只是冰山一角，MicrosoftOfficeVisio在这部分也占据了半壁江山。网络图，平面布置图，建筑设计图，功能之强大让人叹为观止，大佬还是大佬。但我个人还是认为Visio画示意图流程图这方面较好，思维导图方面还是稍逊一筹。
XMind
作为一款开源的思维导图软件，这款软件很适合新手。操作简单，大概也是因为中国制造的软件比较符合国人的操作思维。有免费版本，功能也比较全，是那种小女生会十分喜欢用的思维导图软件。
MindManage
这款软件和XMind没太大区别吧，不过在windows系统里，MindManager的稳定性和性能还是要强于XMind的，XMind的主战场在MAC。用户也都很难说出哪个好，哪个差。
MindMaster
亿图（EDrawMax）推出的一款跨平台多功能思维导图软件，亿图本身就是一款绘图软件，在这方面的软件开发还是有一定基础的。MindMaster这几年确实也赢得不少口碑。支持多种导出格式，主题样式也很多。性价比很高的一款软件。
EDrawMax
亿图，MIndMaster的上线。功能强大，包括拓扑图，流程图，思维导图等在内，可以绘制多种图，很多人都说是Visio的代替款，其实也不算夸大海口。一键导入功能很方便，不想下载的话还有网页版。
八、翻译软件
其实我的论文就是自己啃下来，速度很慢，不过这一两年下来比之前好很多。翻译网址还好，翻译软件是这次特意查了资料做了功课，如有不全或者不专业的地方还望指出。
1入门软件
MicrosoftOfficeWord/WPSoffice
写这期之前只知道这两位大佬牛逼，不知道如此牛逼。没错，这两个都可以翻译。里面都有选取翻译和全文翻译。翻译准确度不能指望多好，但是至少能理解文章大概意思。MicrosoftOfficeWord是跳转到第三方翻译，WPSoffice这个功能是VIP才可以用。
有道词典
一款我自己在用的翻译软件，我用它主要是翻译词汇。但这款软件近几年功能做的还挺完善的，除了翻译词汇，大的段落，还可以上传文档（pdf/doc/docx）进行全文翻译，但是翻译结果的导出有VIP限制。作为基础的翻译软件，这个也是足够了。
2进阶软件
SCITranslate
不用想，这名字一听就很专业对不对，带上SCI我就觉得莫名信赖。这个软件翻译生物医学等专业词汇的精准度较高，打开相关文献根据鼠标指向进行翻译。还有生词表记忆的功能，不过安装是真的有点麻烦。
CopyTranslator
功能如其名，复制即可翻译。有对照模式，也可以只显示翻译内容。不能说专业性多强，但有一个功能很强大：pdf版本的文字复制粘贴到网页翻译后断行会出现偏差，需要手动调整，这个软件只要复制一下，浮窗就会自动出现翻译结果，无需手动删除。
如果指望一款软件可以完全解决你看文献的苦恼是不可能的，都只是辅助功能，帮助你更好的理解或者记忆，还是要靠自己慢慢积累的~
九、结果保存
当你完成了其余所有的科研步骤，一定不要忘记最重要的一步：结果保存。我不建议统一放到U盘或者存在电脑里，这样的方法太依赖于设备的稳定性，还是云保存比较靠谱。我的师兄就是交换期把在美国做的实验结果保存在电脑里，回国之后电脑坏了，真的是两国忙活才没影响毕业。一定要重视结果保存，而且要统一管理。
百度云：
这个是国内最常见的云储存软件了，相比于其他软件储存空间很大，我的是2个T的储存空间。图片，文件，视频，甚至我很多想用还没来得及安装的软件安装包都放在了里面。云储存软件其实除了保存这个主要功能不要需求太多了。这里提一下，百度云上传和下载是限速的。
坚果云：
相比百度云，坚果云更适合团队协作，在坚果云可以邀请其他人共用文件夹进行协作。此外，实时同步云储存也是坚果云的一大特色，而且坚果云不限速也成为了一大亮点，上传和下载的速度只受设备影响。缺点就是空间不大，以流量计算上传下载，免费版一个月只有1GB上传流量和3GB下载流量。
坚果云Dropbox：
Dropbox真的是云储存软件里的行业老大，超过一亿用户就能看出其被认可度。但是在不适合在国内使用。但是作为云储存软件的行业标杆，各家学习的对象，还是要说一下。Dropbox支持大量文件同步，众多应用接入。坚果云就是Dropbox很好的追随者。
OneDrive：
过去叫SkyDrive，是微软公司旗下的软件。OneDrive在国内比Dropbox要好些，至少客户端是可以使用的。微软旗下的软件在Office文件支持方面肯定是做的相对较好，其他相比于Dropbox看不出什么亮点。
iCloudDrive这里不想提了，我个人是苹果用户，也觉得好用，但是这里不想介绍设备限制很强的软件，望理解。
终于写完最后一个part，真的是要吐血了，爆肝总结绝对干货，科研路上一起努力！看完的小可爱一定要
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